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    教你一招 :如何從一份土壤樣本中同時提取微生物RNA和DNA
    作者 :   發表時間 :2019-09-03


    環境微生物組最常見的樣本類型就是土壤 ,但土壤樣本種類繁多 、組分也相對複雜 ,並且微生物細胞緊緊吸附在土壤顆粒表麵且有大量的抑製劑存在 ,使得從土壤樣本中獲取無偏好 、高質量的微生物總DNA或RNA具有很大難度 。



    (一)為什麽土壤樣本微生物核酸很難提取的比較好呢 ?

    1

    微生物裂解不充分,核酸不能夠充分釋放 ,也會影響微生物多樣性的評估

    2

    土壤種含有的很多抑製劑 :腐殖質(腐植酸 ,黃腐酸等腐殖質)含量高 ,去除不好會嚴重影響下遊PCR ,文庫構建等一係列下遊實驗 。



    (二)QIAGEN如何做到土壤樣本微生物充分裂解和抑製劑徹底去除呢 ?


    新一代珠磨研磨管——微生物高效裂解法寶

    如何高效裂解土壤中的微生物細胞是萬裏長征的第一步,否則不能保證微生物多樣性 。這個裂解管有三大作用 :幫助分散土壤顆粒 ;有效提高微生物和裂解珠碰撞幾率 ;高效裂解革蘭氏陽性菌 。

    比如 :

     

    A. 1.8ml白念珠菌分別用DNeasy PowerSoil Kit及DNeasy PowerSoil Pro Kit提取結果比較 。

    B 、250mg堆肥 、粘土 、表層土壤樣本分別用DNeasy PowerSoil Kit及DNeasy PowerSoil Pro Kit提取結果比較 。


    第二代IRT技術——腐植酸

    困擾土壤樣本DNA提取的最大問題是其中的腐殖質(腐植酸 ,黃腐酸等腐殖質)含量高 。腐植酸由有機物降解形成 ,並使得土壤呈現黑顏色(苯醌基的分子結構) 。腐植酸分子都含有羧基和酚基 ,分子量大小不一 ,它們與核酸一樣都是大分子親水性陰離子聚合物 ,很容易在最後步驟和核酸一起被抽提出來 。

    QIAGEN的一種創新的專利方法 ,致富彩票稱之為第二代抑製劑去除技術(IRT) ,專為高腐植酸含量的環境樣品所設計 ,難以處理的土壤樣本類型等如堆肥 ,沉積物和肥料等 。經升級版的IRT技術處理後的DNA可獲得A260/280比值接近1.8的保證 ,核酸A260/230比值也是同類產品中最高的 。

    比如 :

     

    市麵上常見各款試劑盒抽提250mg土壤樣本DNA質量比較 。

    A. DNeasy PowerSoil Pro Kit A260/280比值最接近1.8  

    B. DNeasy PowerSoil Pro Kit A260/230比值最高


    MB矽膠膜離心柱——高品質DNA又一保證

    眾所周知的QIAGEN矽膠膜品質 ,致富彩票無需贅述了 。在這一款全新土壤微生物DNA純化試劑中 ,可以說QIAGEN將結合 、洗滌 、洗脫的buffer和專用微生物核酸矽膠膜離心柱MB Spin Column的使用配合達到了最優化配置 。


     QIAGEN在微生物組研究領域的領導地位

    作為樣本製備 ,二代測序和數據分析研究解決方案的行業先驅 ,QIAGEN是全球微生物組研究計劃的知名支持者 。國際微生物組項目如人類微生物組計劃(HMP) ,地球微生物組計劃(EMP)和地鐵微生物組聯盟計劃(Meta SUB)都正在使用及推薦QIAGEN的微生物組產品 。



    (三)為什麽QIANGEN可以同時從土壤樣本中同時提取RNA和DNA ?

    同一份土壤樣本 ,按照操作步驟先把RNA洗脫下來 ,再利用一個DNA洗脫柱就可以完美的分離一份土壤樣本中的RNA和DNA。

     



    這麽好的產品一定要搞點事情


    為了讓大家可以更好的體驗土壤RNA+DNA產品線的組合效果 ,從即日起QIAGEN正式推出“土壤RNA+DNA同時提取專享促銷方案” ,廣東地區用戶可享受以下產品62折優惠 ,讓您在今夏能夠更好的親自去體驗最佳土壤RNA+DNA分離方法 。

    活動持續到2019年10月22日 ,趕快抓緊時間訂購吧!



    產品信息/參數


    產品 貨號 促銷價(兩個貨號同時購買即可享受超值優惠價
    RNeasy PowerSoil Total RNA Kit 12866-25 3274元
    RNeasy PowerSoil DNA Elution Kit 12867-25


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